如何使用R改变y尺度，以大步骤开始，然后以短步骤完成，以突出处理之间的差异？

我想绘制两个细胞群体之间的平均差异，这是非常有意义的（P < 0.001）。然而，使用的规模不适合看到这种差异。这里是我的代码：如何使用R改变y尺度，以大步骤开始，然后以短步骤完成，以突出处理之间的差异？

ggplot(sh2_sum, aes(treatment,diameter,fill=treatment)) + 
    geom_bar(colour='black', width=.7, position=position_dodge(), 
      stat='identity',size=.2) + 
    coord_cartesian(ylim=c(0, .4)) + 
    xlab("") + ylab("Diámetro de la cabeza de la espina (µm)") + 
    scale_fill_manual(values=c("#009900", "#990000"),name='') + 
    geom_errorbar(aes(ymin=diameter, ymax=diameter+se),width=.3, 
        size=.2,position=position_dodge(.7)) + 
    theme(legend.direction='horizontal',legend.position=c(.5325,-.085), 
      plot.margin=unit(c(0,1,1,1),'cm'), axis.text.x = element_blank()) + 
    annotate("text", x=2, y=.355, label="* * *")

这是图我得到：

original graph

我曾尝试使用scale_y_log10()但我得到以下错误：

Error in seq.default(min, max, by = by) : 'from' must be a finite number In addition: Warning message: Transformation introduced infinite values in continuous y-axis

我会喜欢使用scale_y_sqrt这种类型的值，从0到3的值很短，然后从3到4的值很大，所以差值是可见的ible 任何想法？

来源

2017-10-28 Dementor Yea

我想你应该考虑放大一下你对'coord_cartesian'感兴趣的领域，或者把'geom_bar'完全放在'geom_pointrange'的位置，而不是引入任意的尺度转换 –

平方根和日志会放大'y'较小时的差异，'y'较大时的压缩值。翘曲你的数据，使其看起来相对差异比实际大，你会想要某种指数变换，也许'exp（y）'或'y^2'。或者，不那么具有欺骗性，按照Mikko的建议 - 线图或散点图预计不会从0开始，因此您可以更多地关注差异而不是绝对量级。 – Gregor

对数转换后的y轴从不对于条形图是有意义的，因为bars always start at 0和log（0）不是有用的值（因此是错误消息）。

您可以使用其他，零微转换（例如asinh），但容易很多，也更有意义的，解决办法是抛弃条形图和使用的箱线图（geom_boxplot）来代替。

实际上，你所拥有的称为“dynamite plot”，它是一个经典的可视化anti-pattern。

来源

2017-10-28 13:34:30

如何使用R改变y尺度，以大步骤开始，然后以短步骤完成，以突出处理之间的差异？

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