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Question

列

平均I具有在那个文件中像这样的输入文件中的每个列由标签空间

22 2222 . T C . . ;AA=1;AFE=1;ASNE=1;EUN=1;AFW=1;MED=1;LAT=1; 
22 222 . T C . . ;AA=2;AFE=2;ASNE=2;EUN=2;AFW=2;MED=2;LAT=2; 

分离和我需要的输出如下

22 2222 . T C . . ;AA=1;AFE=1;ASNE=1;EUN=1;AFW=1;MED=1;LAT=1;AVG=1; 
22 222 . T C . . ;AA=2;AFE=2;ASNE=2;EUN=2;AFW=2;MED=2;LAT=2;AVG=2; 

在哪里AVG是第8列所有领域的平均值。

Answer 1

这里是一个办法：

awk '{c=0;for(i=2;i<=NF;i++){split($i,d,"=");c+=d[2]}$NF="AVG="c/(NF-2)FS}1' FS=';' OFS=';' file 
    22 2222 . T C . . ;AA=1;AFE=1;ASNE=1;EUN=1;AFW=1;MED=1;LAT=1;AVG=1; 
    22 222 . T C . . ;AA=2;AFE=2;ASNE=2;EUN=2;AFW=2;MED=2;LAT=2;AVG=2;