匹配行和猫多个文件合并成一个文件

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文件1文件：

DAEQUEG00000025 FP3SLUG00002140 FOMPING00001058 
DAEQUEG00001923 FP3SLUG00002391 FOMPING00000186 
DAEQUEG00000047 FP3SLUG00002116 FOMPING00001081 
DAEQUEG00000321 FP3SLUG00006281 FOMPING00000374

和我有相同数量的文件，并命名同样的方式（DAEQUEG00000025.fa FP3SLUG00002140.fa FOMPING00001058.fa）

我想第一行cat文件的列表，并将其匹配到一个文件中。

预期输出（在一个文件中第一行）

 
>DAEQUEG00000025 
ATGTTGTTTAGATTGGCCCGGCGAGCTACAAGCCCGCTCACCCGCTCGATGGCGACGCAT 
GCGCGAGGACTCCCTGCTCTACTCGAGAAGAAACCAGACGATGTAGTCATAACATTCGCA 
>FP3SLUG00002140 
AAGCGTACTGCTATGGCACGCGCGAGGAAGGGTCAGCTAAAGGACATCCCTGTCGACGAG 
>FOMPING00001058 
CTTATGCAGGCTCTCATCAAGACTCAGCTCGATCCAGCTATGCTAGAGGACATATGCGTA 
GGGACTTGTCACCCTCCGTCACCGACGTACATCTCTCGAGCAGCTGCTCTTGCTGCTGGA

来源

2017-02-14 kapr0001

* 4426行*和*我有相同数量的文件*意味着4426个文件？ – RomanPerekhrest

..你为自己尝试了什么，你失败了什么？ – Inian

只是第一行？那么你想猫共有3个文件？ – jas

你可以试试，

while read -r a b c; do 
    cat "$a.fa" "$b.fa" "$c.fa" > "${a}_${b}_${c}.fa"; 
done < file1

你得到几个文件以化合物名称作为输出，例如

DAEQUEG00000025_FP3SLUG00002140_FOMPING00001058 .fa

 
>DAEQUEG00000025 
ATGTTGTTTAGATTGGCCCGGCGAGCTACAAGCCCGCTCACCCGCTCGATGGCGACGCAT 
GCGCGAGGACTCCCTGCTCTACTCGAGAAGAAACCAGACGATGTAGTCATAACATTCGCA 
>FP3SLUG00002140 
AAGCGTACTGCTATGGCACGCGCGAGGAAGGGTCAGCTAAAGGACATCCCTGTCGACGAG 
>FOMPING00001058 
CTTATGCAGGCTCTCATCAAGACTCAGCTCGATCCAGCTATGCTAGAGGACATATGCGTA 
GGGACTTGTCACCCTCCGTCACCGACGTACATCTCTCGAGCAGCTGCTCTTGCTGCTGGA

来源

2017-02-14 15:49:47

匹配行和猫多个文件合并成一个文件

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