打印大写发生

2015-10-21 66 views -1 likes

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“FILE1.TXT”看起来是这样的：打印大写发生

_1ss4TG actaaAAAACAAGTAAGCGTAATTCCTCCtagataataaaTTTACTAGTtata 
osa-miR5523_L-1R+1 actaaAAAACAAGTAAGacatGAGGAGGAACATATTTACTAGTtata 
ath-miR156a-5p ggaggTGACAGAatgcgtgctcaccctctatctgtcaccccc

我想打印在第三列大写的发生，所以它看起来像这样：

_1ss4TG actaaAAAACAAGTAAGCGTAATTCCTCCtagataataaaTTTACTAGTtata 33 
osa-miR5523_L-1R+1 actaaAAAACAAGTAAGacatGAGGAGGAACATATTTACTAGTtata 34 
ath-miR156a-5p ggaggTGACAGAatgcgtgctcaccctctatctgtcaccccc 7

我已经尝试过使用grep和awk，但是我没有正确的使用它。

来源

2015-10-21 Ramirous

回答

awk '{NF+=1;$3=length(gensub("[a-z]","","g",$2))}1' b 
_1ss4TG actaaAAAACAAGTAAGCGTAATTCCTCCtagataataaaTTTACTAGTtata 33 
osa-miR5523_L-1R+1 actaaAAAACAAGTAAGacatGAGGAGGAACATATTTACTAGTtata 34 
ath-miR156a-5p ggaggTGACAGAatgcgtgctcaccctctatctgtcaccccc 7

来源

2015-10-21 05:49:05 bian

也许对未来的访问者有些阐述？ – ptierno

优秀！我不太明白答案，但它完美地工作。 – Ramirous

打印大写发生

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