NetworkX read_shp需要GDAL

Question

我在运行python3的jupyter笔记本上的mac上。通过路线图上的项目推动自己学习更多python。

我阅读shape文件像这样

import networkx as nx 
g = nx.read_shp('Road files/geo_export_4d537b7d-a470-4eb9-b147-1d0ea89e6b60.shp') 

，它的工作花花公子。

但是后来我读到OSMnx并认为“这真的很酷！我可以动态地拉取shapefile，而不是在线上追捕它们”。

所以我试图安装（pip install osmnx）但不断失败。所以我尝试了其他方法（conda install -c conda-forge osmnx）。现在

，我无法再运行我最初networkx read_shp因为这个错误的：

ImportError: read_shp requires OGR: http://www.gdal.org/ 

。我已经去了网站并安装了GDAL，但错误仍然存​​在。

我也不能导入osmnx。在 from fiona.ogrext import Iterator, ItemsIterator, KeysIterator由于

ImportError: dlopen(/Users/sb/anaconda/lib/python3.5/site-packages/fiona/ogrext.cpython-35m-darwin.so, 2): Library not loaded: @rpath/libjpeg.8.dylib 
    Referenced from: /Users/sb/anaconda/lib/libgdal.20.dylib 
    Reason: image not found 

1 \到底什么没我只是做我的环境，它的错误？

2 \如何恢复networkx功能？大概通过适当的GDAL（re？）安装。

3 \我如何准备osmnx？

对不起，这里的模糊开放性，我推动我的代码有点太过于我的能力。

更新 我跑conda config --add channels conda-forge并重新运行conda install gdal和conda install libgdal。

不幸的是我还是错误的，但它是一个不同的错误，声称networkx需要@中（应安装？）

/Users/sb/anaconda/lib/python3.6/site-packages/networkx/readwrite/nx_shp.py in read_shp(path, simplify) 

ImportError: read_shp requires OGR: http://www.gdal.org/ 

FWIW，/Users/sb/anaconda/lib/既有python3.6和python3.5文件夹。

Answer 1

一般情况下，您可能要避免混合conda channels。假设您的环境默认为defaults，然后您通过conda-forge通道安装了OSMnx。在实践中，它通常可以正常工作，但有时它可能会导致包装冲突，如您所看到的。

每OSMnx documentation，你可以在一个干净的，专用的虚拟环境中安装，以确保它是孤立的：

conda create --yes -c conda-forge -n OSMNX python=3 osmnx 
source activate OSMNX 

如果仍然不工作，然后有确实与畅达锻问题打包您的平台和Python版本，在这种情况下，您应该在其conda-forge GitHub repo中打开一个问题。

最后，您可能还会考虑在您的anaconda设置中创建conda-forge最高优先级的通道。请检查您的.condarc文件并确保conda-forge频道位于defaults之上，因此优先。作为another answer别处所暗示的，也有使用康达锻信道，而不是由连续保持默认信道3个主要的原因：在康达锻

1. 软件包可以是更先进的日期比上的默认值通道
2. conda-forge通道上有一些软件包在默认情况下不可用
3. 您更喜欢使用诸如openblas（来自conda-forge）而不是mkl（来自默认值）的依赖项。

Wes McKinney有similarly commented关于使用conda-forge的好处。