grep子目录并保存多个输出

Question

我有32个目录，每个.pdb文件。我如何在这些文件上使用grep并将每个文件保存到特定的输出？

预期输出是一样的东西：

1.pdb > 1_clean.pdb 
2.pdb > 2_clean.pdb 
3.pdb > 3_clean.pdb 
... 
32.pdb > 32_clean.pdb 

我尝试以下，但它没有工作：

grep -r "^ATOM" *.pdb . > *_clean.pdb 

Answer 1

找到 + 壳解决方案：

find -type f -name "[0-9].pdb" -exec sh -c 'fn=$1; n=${fn##*/}; n=${n%.*}; \ 
     grep "^ATOM" "$fn" > "${n}_clean.pdb"' _ {} \;